<link rel="stylesheet" href="styles.f3b1fba60ec7970c.css">

Некодуючі ділянки ДНК як об’єкт дослідження

Ескіз

Файли

20757.pdf (597,42 KB)

Дата

2024

Автори


Назва журналу

Номер ISSN

Назва тому

Видавець

Вінницький національний технічний університет

DOI

Анотація

Розглянуто актуальність дослідження та комп’ютерного моделювання некодуючих ділянок ДНК, показано важливість виявлення інформативних ознак і паттернів в некодуючій послідовності ДНК для науки і медицини, обґрунтовано потребу в розробленні інформаційних інструментів обчислювального аналізу послідовностей ДНК, сформовано перелік інформаційних ресурсів для проведення досліджень в цій області.
The paper reveals the relevance of research and computer modeling of non-coding sections of DNA, it shows the importance of identifying informative features and patterns in non-coding DNA sequences for scientific and medical issues, and it substantiates the need for the development of information tools for computational analysis of DNA sequences. We also formed a list of information resources for conducting research in the area.

Опис

Ключові слова

ДНК , некодуюча нуклеотидна послідовність , обчислювальний аналіз , інформаційні ресурси , біоінформатика , DNA , non-coding nucleotide sequence , computational analysis , information resources , bioinformatics

УДК

[577:575.11]+004.94

Тип документа

Thesis

Мова

uk_UA

Є частиною

Матеріали LІII науково-технічної конференції підрозділів ВНТУ, Вінниця, 20-22 березня 2024 р.

ISSN

Бібліографічний опис

Штофель Д. Х., Каплунський О. А. Некодуючі ділянки ДНК як об’єкт дослідження // Матеріали LІII науково-технічної конференції підрозділів ВНТУ, Вінниця, 20-22 березня 2024 р. Електрон. текст. дані. 2024. URI: https://conferences.vntu.edu.ua/index.php/all-frtzp/all-frtzp-2024/paper/view/20757.

URI

https://ir.lib.vntu.edu.ua/handle/123456789/41530

Зібрання

НТКП ВНТУ. Факультет інформаційних електронних систем (2024)

Схвалення

Рецензія

Доповнено

Цитується в

Список використаної літератури (18)

  1. Alexander R. P., Fang G., Rozowsky J., Snyder M., Gerstein M. B. Annotating non-coding regions of the genome. Nature Reviews Genetics, 2010. Vol. 11 (8). P. 559–571.
  2. Washietl S., Will S., Hendrix D. A., et al. Computational analysis of noncoding RNAs. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA, 2012 Vol. 3 (6). P. 759–778.
  3. Mattick J. S., Amaral P. P., Carninci P., et al. Long non-coding RNAs: definitions, functions, challenges and recommendations. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2023. Vol. 24. P. 430–447.
  4. Doh S. T., Zhang Y., Temple M. H., Cai L. Non-coding sequence retrieval system for comparative genomic analysis of gene regulatory elements. BMC Bioinformatics. 2007. Vol. 8 (1). P. 1–10. https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-94
  5. Paul D. S., Soranzo N., Beck S. Functional interpretation of non‐coding sequence variation: concepts and challenges. Bioessays. 2014. Vol. 36 (2). P. 191–199.
  6. Zeng H., Gifford D. K. Predicting the impact of non-coding variants on DNA methylation. Nucleic acids research. 2017. Vol. 45 (11). P. e99. https://doi.org/10.1093/nar/gkx177
  7. Krude H., Mundlos S., Øien N. C., Opitz R., Schuelke M. What can go wrong in the non-coding genome and how to interpret whole genome sequencing data. Medizinische Genetik, 2021. Vol. 33 (2). P. 121– 131.
  8. Ellingford J. M., Ahn J. W., Bagnall R. D. et al. Recommendations for clinical interpretation of variants found in non-coding regions of the genome. Genome Medicine. 2022. Vol. 14 (1). P. 73. https://doi.org/10.1186/s13073-022-01073-3
  9. Gaulton K. J., Preissl S., Ren B. Interpreting non-coding disease-associated human variants using single-cell epigenomics. Nature Reviews Genetics, 2023. https://doi.org/10.1038/s41576-023-00598-6
  10. Копилов К. В., Копилова К. В. Дослідження некодуючих ділянок ДНК геному різних видів тварин. Розведення і генетика тварин. 2023. Вип. 65. С. 184–190.