| dc.contributor.author | Штофель, Д. Х. | uk |
| dc.contributor.author | Каплунський, О. А. | uk |
| dc.date.accessioned | 2024-04-29T19:16:14Z | |
| dc.date.available | 2024-04-29T19:16:14Z | |
| dc.date.issued | 2024 | |
| dc.identifier.citation | Штофель Д. Х., Каплунський О. А. Некодуючі ділянки ДНК як об’єкт дослідження. Матеріали LІII науково-технічної конференції підрозділів ВНТУ, Вінниця, 20-22 березня 2024 р. Електрон. текст. дані. 2024. URI: https://conferences.vntu.edu.ua/index.php/all-frtzp/all-frtzp-2024/paper/view/20757. | uk |
| dc.identifier.uri | https://ir.lib.vntu.edu.ua//handle/123456789/41530 | |
| dc.description.abstract | Розглянуто актуальність дослідження та комп’ютерного моделювання некодуючих ділянок ДНК, показано важливість виявлення інформативних ознак і паттернів в некодуючій послідовності ДНК для науки і медицини, обґрунтовано потребу в розробленні інформаційних інструментів обчислювального аналізу послідовностей ДНК, сформовано перелік інформаційних ресурсів для проведення досліджень в цій області. | uk |
| dc.description.abstract | The paper reveals the relevance of research and computer modeling of non-coding sections of DNA, it shows the importance of identifying informative features and patterns in non-coding DNA sequences for scientific and medical issues, and it substantiates the need for the development of information tools for computational analysis of DNA sequences. We also formed a list of information resources for conducting research in the area. | en |
| dc.language.iso | uk_UA | uk_UA |
| dc.publisher | ВНТУ | uk |
| dc.relation.ispartof | Матеріали LІII науково-технічної конференції підрозділів ВНТУ, Вінниця, 20-22 березня 2024 р. | uk |
| dc.relation.uri | https://conferences.vntu.edu.ua/index.php/all-frtzp/all-frtzp-2024/paper/view/20757 | |
| dc.subject | ДНК | uk |
| dc.subject | некодуюча нуклеотидна послідовність | uk |
| dc.subject | обчислювальний аналіз | uk |
| dc.subject | інформаційні ресурси | uk |
| dc.subject | біоінформатика | uk |
| dc.subject | DNA | en |
| dc.subject | non-coding nucleotide sequence | en |
| dc.subject | computational analysis | en |
| dc.subject | information resources | en |
| dc.subject | bioinformatics | en |
| dc.title | Некодуючі ділянки ДНК як об’єкт дослідження | uk |
| dc.type | Thesis | |
| dc.identifier.udc | [577:575.11]+004.94 | |
| dc.relation.references | Alexander R. P., Fang G., Rozowsky J., Snyder M., Gerstein M. B. Annotating non-coding regions
of the genome. Nature Reviews Genetics, 2010. Vol. 11 (8). P. 559–571. | en |
| dc.relation.references | Washietl S., Will S., Hendrix D. A., et al. Computational analysis of noncoding RNAs. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA, 2012 Vol. 3 (6). P. 759–778. | en |
| dc.relation.references | Mattick J. S., Amaral P. P., Carninci P., et al. Long non-coding RNAs: definitions, functions, challenges and recommendations. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2023. Vol. 24. P. 430–447. | en |
| dc.relation.references | Doh S. T., Zhang Y., Temple M. H., Cai L. Non-coding sequence retrieval system for comparative
genomic analysis of gene regulatory elements. BMC Bioinformatics. 2007. Vol. 8 (1). P. 1–10.
https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-94 | en |
| dc.relation.references | Paul D. S., Soranzo N., Beck S. Functional interpretation of non‐coding sequence variation: concepts
and challenges. Bioessays. 2014. Vol. 36 (2). P. 191–199. | en |
| dc.relation.references | Zeng H., Gifford D. K. Predicting the impact of non-coding variants on DNA methylation. Nucleic
acids research. 2017. Vol. 45 (11). P. e99. https://doi.org/10.1093/nar/gkx177 | en |
| dc.relation.references | Krude H., Mundlos S., Øien N. C., Opitz R., Schuelke M. What can go wrong in the non-coding genome and how to interpret whole genome sequencing data. Medizinische Genetik, 2021. Vol. 33 (2). P. 121–
131. | en |
| dc.relation.references | Ellingford J. M., Ahn J. W., Bagnall R. D. et al. Recommendations for clinical interpretation of variants found in non-coding regions of the genome. Genome Medicine. 2022. Vol. 14 (1). P. 73.
https://doi.org/10.1186/s13073-022-01073-3 | en |
| dc.relation.references | Gaulton K. J., Preissl S., Ren B. Interpreting non-coding disease-associated human variants using
single-cell epigenomics. Nature Reviews Genetics, 2023. https://doi.org/10.1038/s41576-023-00598-6 | en |
| dc.relation.references | Копилов К. В., Копилова К. В. Дослідження некодуючих ділянок ДНК геному різних видів
тварин. Розведення і генетика тварин. 2023. Вип. 65. С. 184–190. | en |
| dc.relation.references | NCBI GenBank. URL : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ | en |
| dc.relation.references | NCBI Reference Sequence database https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/ | en |
| dc.relation.references | EMBL's European Bioinformatics Institute. URL : https://www.ebi.ac.uk | en |
| dc.relation.references | Ensembl genome browser. https://useast.ensembl.org/index.html | en |
| dc.relation.references | Protein Data Bank RCSB PDB. URL : https://www.rcsb.org | en |
| dc.relation.references | University of California Santa Cruz Genome Browser https://genome.ucsc.edu/ | en |
| dc.relation.references | DNA Data Bank of Japan https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html | en |
| dc.relation.references | European Nucleotide Archive https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home | en |
